证据图谱
将疾病、基因、靶点、分子和研究纳入一张注明来源的图谱，矛盾之处保持可见，每一项推断均如实标注。
筹备中 - 仅限受邀访问
DNOVA by NEO AI
生物科技智能， 附带证明交付。
DNOVA 是 NEO AI 正在构建的平台，旨在向生物科技团队、投资方和研究合作伙伴开放计算生物学。证据图谱、靶点档案、模型评估和资产审查，均借助 LILI 完成，并各自附带来源、局限以及任何人都可以核验的证明。
艺术示意图，并非真实结构。拖动即可旋转。
生物科技领域的大多数 AI 只给你一个答案。DNOVA 将给你答案、答案所依据的数据、产生答案的计算过程，以及它无法证明的内容。
8项能力正在同一平台上筹备
4项独立的证明声明，附于每一项交付成果
50+个公共数据源纳入连接器范围，每一个在使用前均经过审核
1个 AI 大脑 LILI，与 NEO AI 所有垂直领域共享
平台
DNOVA 正在构建的能力
八项能力集于同一平台，共享相同的数据来源、相同的证明模型和相同的 AI。每一项都在筹备中：此处内容目前均未销售，也尚未开放。
靶点档案
支持和反驳某一靶点的证据、注明来源的在先技术检索，以及验证方案。绝不是临床预测。
分子与靶点
结构、靶点和活性测量值，附带单位、物种和实验方案。IC50、EC50、Ki 和 Kd 从不混同；预测结构与实验结构始终加以区分。
图像模型评估
分割或计数模型在生物图像上的真实表现，在完全相同的方案下比较，数据按培养板、实验室或供体划分。
细胞模型评估
单细胞或扰动模型能否推广到从未见过的情境，与简单基线对比，并给出其不确定性。
临床与竞争雷达
按疾病、靶点、分子、申办方和阶段整理的试验与项目，每一次来源变更均注明日期。
资产审查
对生物科技资产进行科学、竞争和运营层面的审查，列出缺失文件和需要提出的问题。事实、公司陈述与我们的评估相互分开。
合作伙伴空间
为合作实验室、评审人和审计人提供的私有项目空间，按操作、项目和数据类别设置角色与权限。
面向对象
为必须基于证据做出决策的人而建
01
生物科技与制药团队
基于公共数据审视靶点、分子和模型，在决策之前而非之后说明局限。
02
投资方与基金
资产审查将已有文件证明的、对方声称的和我们评估的内容分开，并列出待解决的问题。
03
研究实验室
基于预留数据的评估、合作伙伴空间，以及连同方案与局限一并记录的外部验证。
04
机构与资助方
可复现的档案，评审人或审计人无需信任我们即可自行核查。
引擎
来自 NEO Bio n Tech 的三大研究引擎
DNOVA 依托 NEO Bio n Tech 的计算研究项目运行，NEO Bio n Tech 是 NEO AI 的研究垂直领域。每个项目都针对现有公共数据提出具体、可衡量的问题，并说明哪些已经计算、哪些需要实验室，以及哪些仍属未知。
示意图 - 合成数据
- 有来源的关联
- 由模型推断
- 矛盾证据
证据图谱与可检验的假设
Discovery Atlas
疾病、基因、蛋白质、分子、通路、试验和研究，通过各自带有来源、版本、证据类型及其局限的关系相互连接。
回答的问题
- 哪些人类遗传、表达和干预证据支持或反驳某一靶点在特定适应症中的作用？
- 在完成有记录的在先技术检索后，哪些假设仍未被充分探索？
- 表面上的共识中，有多少来自独立研究，而非重复使用的同一数据集？
产出内容
- 注明来源、日期和版本的证据图谱
- 附反方论点和验证方案的可检验假设
- 附密封证明包的证据档案
事先说明的局限. 在所查阅来源中没有找到结果，并不能证明不存在在先技术。
原始图像模型掩膜拖动分界线
示意图 - 合成数据
图像模型的真实表现
BioVision
在生物图像上进行分割、计数和形态分析，在完全相同的方案下比较，数据按培养板、实验室或供体划分，而非随机按图像划分。
回答的问题
- 分割模型在来自从未见过的实验室的图像上能否保持准确度？
- 常见基准是否因训练图像与测试图像共享培养板或来源而高估了性能？
- 哪些失败模式占主导，代价如何？
产出内容
- 附置信区间、计算时间和成本的基准测试
- 保留并展示失败案例，绝不过滤
- 基于真实结果的可复现报告
事先说明的局限. 在锁定的测试分区上完成测量之前，不宣布任何改进。
示意图 - 合成数据
必须能够推广的预测
Cell Intelligence
以有记录的统计方法分析单细胞和扰动数据，并在模型从未见过的扰动或细胞情境上将其与简单基线进行比较。
回答的问题
- 在考虑不确定性的前提下，候选模型能否在预留扰动上胜过无变化、均值和线性基线？
- 哪些特征在不同研究、供体和批次之间保持一致？
- 模型在哪里失败：按细胞类型、扰动类别还是数据集？
产出内容
- 附置信区间的基线对比
- 基准研究，包括阴性结果
- 记录在 Proof Ledger 中的模型卡
事先说明的局限. 投影中的接近只是视觉辅助，并非机制。
合作流程
从你的问题到可核验的结果
每一次合作都遵循同样的路径。每一步都留下带日期和签名的记录，需要人工决策的步骤无法被软件跳过。
- 01
界定问题
一位指定的科学家与你的团队商定一个精确、可检验的问题。检索已有研究，并列出所查阅的来源。
- 02
确定方案与权利
在接触最终测试数据之前，对比较对象、指标、数据划分、终止规则和数据权利进行版本化管理。
- 03
可溯源地计算
每次运行都会记录数据版本、代码、模型、参数、随机种子和环境。失败的运行和阴性结果都会保留。
- 04
评审、密封、交付
由作者以外的评审人评估某一确切版本。档案经密封并加盖时间戳，你将收到一份可以自行核验的证明。
LILI，AI 科学家
展示自身工作过程的 AI
LILI 是 NEO AI 唯一的大脑，与所有垂直领域共享。在 DNOVA 中，它负责准备方案、检索来源、启动流程和起草档案，并在行动前后向你展示计划、来源、工具和成本。
角色分离
检索、计算、批判和撰写由不同的智能体完成。智能体之间的一致并不构成独立验证。
服务器端校验权限
每一次工具调用都会依据你的权限进行校验。文章和文件中的文本被视为不可信数据。
由人签署
每一项离开平台的科学结论都由一位专业评审人签署。
你可以让 LILI
- 比较某种疾病的三个靶点
- 解释相互矛盾的证据
- 启动图像模型评估
- 比较细胞反应
- 准备可复现的档案
- 解释某一结果为何尚不能分享
>
计划
- 汇集每个靶点的遗传、表达和干预证据
- 去除在多个数据库中重复出现的研究
- 绘制支持与反驳的关联
- 起草附带局限说明的比较
查阅的来源
Open TargetsGWAS CatalogGTExChEMBLClinicalTrials.govEurope PMC
调用的工具
atlas.evidence_map() · studies.deduplicate() · graph.contradictions()
Proof Ledger
四项声明，绝不只是一个绿色徽章
每一项交付成果都附带四项独立声明。它们从不合并，因为一个结果可能完整却尚未复现，也可能已经评审却尚未发表。
技术完整性
文件与其记录的指纹一致。
可复现性
结果是否被重新计算、由谁完成、容差为多少。
科学验证
计算证据、外部实验或独立复现，均如实说明。
发表状态
内部、预印本或经同行评审，附带版本历史。
档案如何密封
档案中的每个文件都会生成指纹。这些指纹被合并为一个根，经签名、由第三方加盖时间戳，并锚定在公共网络上。任何持有这些文件的人都可以进行核验。
区块链锚定证明某个指纹在某一日期已经存在。它不能证明结果是真实的、新颖的或归属于谁。
示意图。指纹在你的浏览器中实时计算。
科学诚信
计算能确立什么，不能确立什么
| 问题 | 通过计算 | 需要实验室 |
|---|---|---|
| 在所查阅的来源中，某个基因是否与某种疾病相关？ | 可以，并注明来源、版本和人群 | 否 |
| 调节某个靶点是否会改变疾病生物学？ | 只能作为假设，并附带支持和反驳的证据 | 是，需与合作实验室按记录的方案进行 |
| 分割模型能否推广到新的实验室？ | 可以，基于按来源划分的预留公共数据 | 仅当不存在独立的公共数据时 |
| 预测的扰动反应在真实细胞中是否成立？ | 与预留的公共测量结果相符 | 是，针对新的细胞系统和新的扰动 |
我们不运营实体实验室。当某一假设需要实验时，将与合作实验室按记录的方案进行测试，并说明该测试的独立性。
数据宇宙
建立在生物学开放基础设施之上
文献、遗传学、分子、蛋白质、细胞、图像、试验和本体，通过官方接口和下载获取。每个来源在使用前都会就访问、许可和权利进行审核。
文献
PubMed · PubMed Central · Europe PMC · BioStudies
疾病与遗传学
Open Targets · GWAS Catalog · ClinVar · gnomAD · GTEx · Ensembl · NCBI Gene · RefSeq · NCBI Datasets · Human Protein Atlas
分子
ChEMBL · PubChem · BindingDB · ChEBI
蛋白质与通路
UniProt · EMBL-EBI Proteins API · RCSB PDB · AlphaFold Database · InterPro · Reactome · STRING
细胞与扰动
GEO · SRA · ENA · CELLxGENE Discover · CELLxGENE Census · scPerturb · Tahoe-100M · LINCS · Connectivity Map · DepMap · CCLE · Open Problems · MetaboLights · MGnify
生物图像
BioImage Archive · IDR · BBBC · Cell Painting Gallery · JUMP Cell Painting · RxRx
试验与公共卫生数据
ClinicalTrials.gov · AACT · openFDA · GDC
本体与专利
OLS · Gene Ontology · HPO · MONDO · Cell Ontology · EFO · EPO OPS · Lens
连接器范围内的来源。名列其中并不意味着合作关系、认可或已测试的集成。受限来源仍然受限。
基于 NEO AI 构建
一个大脑，数据隔离，全面审计
唯一的 LILI
DNOVA 通过版本化网关，使用与 NEO AI 各垂直领域相同的 LILI。没有第二个大脑，也没有自有的服务商密钥。
你的数据始终属于你
DNOVA 拥有独立的数据库、用户、工具和权限。未经明确的书面授权，合作伙伴和客户的数据绝不会用于研究或模型。
中央 Super Admin
通过共享的 NEO AI 控制台管理配置、用户、权利、配额、预算、暂停和审计。每一次例外访问都需说明理由并记录在案。
邀请制账户
不开放公开注册。合作伙伴、评审人和审计人受邀参与特定项目，并按操作、项目和数据类别设置角色与权限。